strain numRAYTs NumREPINsLargestCluster masterSequence mastersequenceFreq allREP numberOfRepinClusters allREPINs REPINNumMasterDist_3 Smalt_PEG-141 4 51 GTGTCGACCTTGGTCGACACGGTGTCGACCAAGGTCGACACC 27 352 9 336 51 Smalt_FDAARGOS_1044 3 31 GTGTCGACCAAGGTCGACACCGTGTCGACCTTGGTCGACACG 20 212 6 186 31 Smalt_NCTC13014 3 40 GTGTCGACCAAGGTCGACACCGTGTCGACCTTGGTCGACACG 22 238 6 211 42 Smalt_AB550 2 13 GCGCCAACCAAGGTTGGCGGCGTGCCCACCAAGGTGGGCAGC 6 255 2 75 15 Smalt_W18 4 32 GTGCCAACCTTGGTTGGCACGGTGCCAACCAAGGTTGGCACC 19 101 2 94 36 Smalt_FDAARGOS_325 2 6 ATGCCAACCTTGGTTGGCATGATGCCAACCAAGGTTGGCATC 2 125 0 35 6 Smalt_ICU331 2 4 GTGCCAACCAAGGTTGGCACCATGCCAACCAAGGTTGGCATC 2 162 0 27 7 Smalt_SJTH1 3 45 GTGTCGACCAAGGTCGACACCGTGTCGACCTTGGTCGACACG 21 315 5 271 46 Smalt_SJTL3 2 39 GTGTCGACCTTGGTCGACACGGTGTCGACCAAGGTCGACACC 21 298 5 275 41 Smalt_D457 3 20 GCGCCGACCAAGGTCGGCATCGGGCCAACCAAGGTTGGCACC 4 210 1 61 18 Smalt_T50-20 4 59 GTGCCAACCTTGGTTGGCACGGTGCCAACCAAGGTTGGCACC 30 347 5 312 63 Smalt_Sm53 3 28 GTGTCGACCTTGGTCGACACGGTGTCGACCAAGGTCGACACC 14 212 5 177 33 Smalt_Col1 2 32 GTGTCGACCTTGGTCGACACGGTGTCGACCAAGGTCGACACC 17 207 5 193 32 Smalt_PEG-68 3 9 GCGCCAACCAAGGTTGGCGGCGTGCCCACCAAGGTGGGCAGC 6 216 1 61 9 Smalt_NCTC10257 3 31 GTGTCGACCAAGGTCGACACCGTGTCGACCTTGGTCGACACG 20 212 6 186 31 Smalt_PEG-42 3 26 GTGCCAACCTTGGTTGGCACGGTGCCAACCAAGGTTGGCACC 14 96 2 90 28 Smalt_PEG-390 4 14 GTGCCAACCTTGGTTGGCACGGTGCCAACCAAGGTTGGCACC 4 62 0 31 14 Smalt_NCTC10498 3 5 ATGCCAACCAAGGTTGGCATCGTGCCAACCAAGGTTGGCACC 3 156 0 18 5 Smalt_NCTC10259 3 10 GCGCCGACCAAGGTCGGCCTCGTGCCAACCAAGGTTGGCACC 3 158 0 38 12 Smalt_NCTC10258 3 32 GTGTCGACCTTGGTCGACACGGTGTCGACCAAGGTCGACACC 16 211 5 188 32 Smalt_PEG-173 4 48 GTGTCGACCTTGGTCGACACGGTGTCGACCAAGGTCGACACC 27 358 6 332 48 Smalt_DHHJ 4 22 GCGCCGACCAAGGTCGGCATCGTGCCAACCAAGGTTGGCACC 4 269 2 94 21 Smalt_O1 3 3 GTGTCGACCAAGGTCGACACCGTGTCGACCAAGGTCGACACC 2 166 0 25 3 Smalt_sm454 3 34 GTGCCAACCAAGGTTGGCACCGTGCCAACCTTGGTTGGCACA 12 161 2 134 34 Smalt_CF13 1 9 GCGCCGACCAAGGTCGGCATCGTGCCAACCAAGGTTGGCACC 3 123 0 26 9 Smalt_CPBW01 3 7 GTGCCAACCAAGGTTGGCACCGCGCCGACCAAGGTCGGCCTC 4 111 0 24 7 Smalt_MER1 2 15 GTGCCAACCAAGGTTGGCACCGTGCCAACCAAGGTTGGCACC 2 249 1 55 18 Smalt_ISMMS3 3 38 GTGTCGACCTTGGTCGACACGGTGTCGACCAAGGTCGACACC 21 264 6 229 38 Smalt_JV3 3 5 GTGCCAACCAAGGTTGGCACCGCGCCAACCAAGGTTGGCATC 2 136 0 21 6 Smalt_SM866 4 28 GCGCCGACCAAGGTCGGCATCGTGCCAACCAAGGTTGGCACC 10 322 1 123 36 Smalt_FDAARGOS_649 3 4 GTGTCGACCAAGGTCGACACCGTGTCGACCAAGGTCGACACC 3 176 0 28 4 Smalt_K279a 2 7 ATGCCAACCAAGGTTGGCATCGTGCCAACCAAGGTTGGCACC 4 171 0 38 9 Smalt_CSM2 3 30 GTGTCGACCAAGGTCGACACCGTGTCGACCTTGGTCGACACG 20 230 5 201 30 Smalt_FDAARGOS_92 3 40 GTGTCGACCTTGGTCGACACGGTGTCGACCAAGGTCGACACC 21 261 6 223 40 Smalt_SKK55 2 3 GCGCCAACCAAGGTTGACGACATGCCAACCAAGGTTGGCATC 2 55 0 7 3