strain	numRAYTs	NumREPINsLargestCluster	masterSequence	mastersequenceFreq	allREP	numberOfRepinClusters	allREPINs	REPINNumMasterDist_3
Smalt_NCTC13014	3	89	AGCCGAGCATGGGCTCGGCTCAGCCGAGCCCATGCTCGGCTG	51	298	4	291	124
Smalt_AB550	2	65	AGCCGAGCGTGGGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	9	137	1	72	61
Smalt_W18	4	84	AGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	52	271	4	266	121
Smalt_ICU331	2	8	AGCCGAGCGTGGGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	2	36	0	9	8
Smalt_SJTH1	3	75	AGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	39	246	4	241	100
Smalt_SoD9b	2	65	AGCCGAGCGTGGGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	6	148	1	70	52
Smalt_SJTL3	2	31	AGCCGAGCATGGGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	6	91	1	31	29
Smalt_D457	3	62	AGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	38	285	4	273	113
Smalt_T50-20	4	6	AGCCGAGCATGGGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	2	44	0	11	9
Smalt_Col1	2	87	AGCCGAGCATGGGCTCGGCTCAGCCGAGCCCATGCTCGGCTG	53	362	4	359	153
Smalt_PEG-68	3	74	AGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	47	290	4	282	115
Smalt_PEG-42	3	88	AGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	54	282	4	279	126
Smalt_PEG-390	4	109	AGCCGAGCATGGGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	24	207	1	115	103
Smalt_NCTC10498	3	7	AGCCGAGCATGGGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	2	34	0	10	7
Smalt_OUC_Est10	3	29	AGCCGAGCATGGGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	7	93	1	32	29
Smalt_NCTC10259	3	75	AGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	51	296	4	289	118
Smalt_R551-3	2	44	AGCCGAGCATGGGCTCGGCTCAGCCGAGCCCATGCTCGGCTG	25	130	4	126	56
Smalt_DHHJ	4	3	AGCCGAGCATGGGCTCGGCTCAGCCGAGCGTAGGCTCGGCTC	1	37	0	5	4
Smalt_O1	3	8	AGCCGAGCGTGGGCTCGGCTCGGCCGAGCATGGGCTTGGCTC	1	34	0	10	5
Smalt_ISMMS2R	3	119	AGCCGAGCATGGGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	27	203	1	120	115
Smalt_AA1	4	41	AGCCGAGCATGGGCTCGGCTCAGCCGAGCCCATGCTCGGCTG	27	112	2	111	52
Smalt_X28	2	26	AGCCGAGCATGGGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	6	71	1	30	25
Smalt_CPBW01	3	119	AGCCGAGCATGGGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	28	201	1	121	112
Smalt_FDAARGOS_507	3	10	AGCCGAGCATGGGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	2	44	0	12	10
Smalt_MER1	2	20	AGCCGAGCGTGGGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	4	52	1	20	19
Smalt_sm-RA9	2	41	AGCCGAGCATGGGCTCGGCTCAGCCGAGCCCATGCTCGGCTG	24	124	4	119	57
Smalt_JV3	3	5	AGCCGAGCGTGGGCTCGGCTCAGCCGAGCGTGGGCTCGGCTC	1	45	0	6	4
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Smalt_CSM2	3	13	AGCCGAGCATGGGCTCGGCTCAGCCGAGCCCATGCTCGGCTG	7	58	2	55	19
Smalt_KMM349	2	40	AGCCGAGCATGGGCTCGGCTCAGCCGAGCCCATGCTCGGCTG	23	120	4	115	59
Smalt_SKK55	2	89	AGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCATGGGCTCGGCTC	55	381	4	376	153