strain numRAYTs NumREPINsLargestCluster masterSequence mastersequenceFreq allREP numberOfRepinClusters allREPINs REPINNumMasterDist_3 Smalt_NCTC13014 3 89 CAGCCGAGCATGGGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 51 298 4 291 124 Smalt_AB550 2 65 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 9 137 1 72 60 Smalt_W18 4 84 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCT 52 271 4 266 121 Smalt_ICU331 2 8 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCCCACGCTCGGCT 2 36 0 9 8 Smalt_SJTH1 3 75 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCT 39 246 4 241 100 Smalt_SoD9b 2 65 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCCCACGCTCGGCT 6 148 1 70 52 Smalt_SJTL3 2 31 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 6 91 1 31 29 Smalt_D457 3 62 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCT 38 285 4 273 113 Smalt_T50-20 4 6 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 2 44 0 11 9 Smalt_Col1 2 87 CAGCCGAGCATGGGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 53 362 4 359 153 Smalt_PEG-68 3 74 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCT 47 290 4 282 115 Smalt_PEG-42 3 88 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCT 54 282 4 279 126 Smalt_PEG-390 4 109 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 24 207 1 115 103 Smalt_NCTC10498 3 7 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 2 34 0 10 7 Smalt_OUC_Est10 3 29 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 7 93 1 32 29 Smalt_NCTC10259 3 75 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCT 51 296 4 289 118 Smalt_R551-3 2 44 CAGCCGAGCATGGGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 25 130 4 126 56 Smalt_DHHJ 4 3 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCTCATGCTCGGCT 1 37 0 5 3 Smalt_O1 3 8 GAGCCGAGCCCACGCTCGGCTGAGCCGAGCCCACGCTCGGCT 1 34 0 10 8 Smalt_ISMMS2R 3 119 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 27 203 1 120 115 Smalt_AA1 4 41 CAGCCGAGCATGGGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 27 112 2 111 52 Smalt_X28 2 26 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 6 71 1 30 25 Smalt_CPBW01 3 119 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 28 201 1 121 112 Smalt_FDAARGOS_507 3 10 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 2 44 0 12 10 Smalt_MER1 2 20 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 4 52 1 20 20 Smalt_sm-RA9 2 41 CAGCCGAGCATGGGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 24 124 4 119 57 Smalt_JV3 3 5 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 1 45 0 6 5 Smalt_SM866 4 6 GAGCCGAGCCTACGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 1 41 0 8 3 Smalt_ISMMS2 3 119 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 27 203 1 120 115 Smalt_K279a 2 8 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 2 42 0 9 8 Smalt_CSM2 3 13 CAGCCGAGCATGGGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 7 58 2 55 19 Smalt_KMM349 2 40 CAGCCGAGCATGGGCTCGGCTGAGCCGAGCCCATGCTCGGCT 23 120 4 115 59 Smalt_SKK55 2 89 GAGCCGAGCCCATGCTCGGCTCAGCCGAGCATGGGCTCGGCT 55 381 4 376 153