strain	numRAYTs	NumREPINsLargestCluster	masterSequence	mastersequenceFreq	allREP	numberOfRepinClusters	allREPINs	REPINNumMasterDist_3
Smalt_PEG-141	4	25	AGAGTCGAGCCATGCTCGACTAGAGTCGAGCCATGCTCGACT	8	133	1	31	25
Smalt_NCTC13014	3	27	AGAGTCGAGCCATGCTCGACTAGAGTCGAGCCATGCTCGACT	9	204	3	54	37
Smalt_AB550	2	10	AGAGCCGAGCCATGCTCGGCTAGAGCCGAGCCATGCTCGGCT	3	90	0	22	11
Smalt_W18	4	35	AGAGTCGAGCCATGCTCGACTAGAGTCGAGCCATGCTCGACT	12	177	2	56	41
Smalt_SJTL3	2	52	GCAGTCGAGCATGGCTCGACTAGAGTCGAGCCATGCTCGACT	23	192	5	179	58
Smalt_D457	3	5	AGAGTCGCGCCATGCTCGACTAGAGTCGAGCCATGCTCGACG	1	47	0	7	3
Smalt_T50-20	4	22	AGAGTCGAGCCATGCTCGACTAGAGTCGAGCCATGCTCGACT	8	137	1	34	26
Smalt_Col1	2	14	AGAGCCGAGCCATGCTCGGCTAGAGCCGAGCCATGCTCGGCT	6	149	1	40	21
Smalt_PEG-68	3	11	AGAGCCGAGCCATGCTCGGCTAGAGCCGAGCCATGCTCGGCT	5	98	1	23	14
Smalt_PEG-42	3	27	AGAGCCGAGCCATGCTCGGCTAGAGCCGAGCCATGCTCGGCT	9	178	2	56	31
Smalt_PEG-390	4	50	TCCGCCGGGCATGGCCCGGCGAGCGCCGGGCCATGCCCGGCG	12	261	2	169	52
Smalt_NCTC10259	3	10	AGAGCCGAGCCATGCTCGGCTAGAGCCGAGCCATGCTCGGCT	5	102	1	23	14
Smalt_PEG-173	4	15	AGAGTCGAGCCATGCTCGACTAGAGTCGAGCCATGCTCGACT	5	94	1	18	18
Smalt_R551-3	2	36	GCAGTCGAGCATGGCTCGACTAGAGTCGAGCCATGCTCGACT	13	134	4	120	37
Smalt_DHHJ	4	32	AGAGTCGAGCCATGCTCGACTAGAGTCGAGCCATGCTCGACT	11	210	1	41	31
Smalt_ISMMS2R	3	78	AGCGCCGGGCCATGCCCGGCGGCCGCCGGGCATGGCCCGGCG	20	349	3	229	78
Smalt_AA1	4	9	AGAGTCGAGCCATGCTCGACTAGAGTCGAGCCATGCTCGACT	6	42	0	9	9
Smalt_CPBW01	3	81	AGCGCCGGGCCATGCCCGGCGGCCGCCGGGCATGGCCCGGCG	19	348	3	224	77
Smalt_sm-RA9	2	36	AGAGTCGAGCCATGCTCGACTAGAGTCGAGCCATGCTCGACT	18	122	1	41	36
Smalt_ISMMS3	3	36	AGAGTCGAGCCATGCTCGACTAGAGTCGAGCCATGCTCGACT	21	132	1	43	37
Smalt_JV3	3	45	AGAGTCGAGCCATGCTCGACTAGAGTCGAGCCATGCTCGACT	25	157	1	56	48
Smalt_SM866	4	13	AGAGTCGAGCCATGCTCGACTAGAGTCGAGCCATGCTCGACT	4	88	1	16	15
Smalt_ISMMS2	3	78	AGCGCCGGGCCATGCCCGGCGGCCGCCGGGCATGGCCCGGCG	20	349	3	229	78
Smalt_CSM2	3	12	AGAGTCGAGCCATGCTCGACTAGAGTCGAGCCATGCTCGACT	6	101	1	24	19
Smalt_KMM349	2	33	AGAGTCGAGCCATGCTCGACTAGAGTCGAGCCATGCTCGACT	15	117	1	38	33
Smalt_SKK55	2	49	CTCGCCGGGCATGGCCCGGCGAGCGCCGGGCCATGCCCGGCG	12	255	3	163	48